Da Wikipedia: ambientata nell'era moderna, la storia parla di Miharu Rokujou, che voleva solo vivere una vita normale ed ereditare un ristorante Okonomiyaki. Al momento, il suo problema più grande era il costante assillo di Kouichi Aizawa e Durandal Thobari Kumohira, che fondarono un club Nindō (忍 道?, Letteralmente "Way of the Ninja"). Miharu non voleva avere niente a che fare con i "ninja" e li rifiuta ogni volta. Ma presto, viene attaccato da un vero gruppo di ninja ed è protetto da Kouichi e Kumohira. Lì, Miharu apprende del mondo ninja nascosto Nabari, i ruoli del suo compagno di classe e insegnante in quel mondo, e dell'arte segreta Shinra Banshou (森羅 万象 Shinrabanshō ?, lett. "Tutte le cose in natura") dentro di lui. L'arte segreta, che contiene tutta la conoscenza del mondo, è molto ambita a Nabari. E a causa di ciò, Miharu non può tornare alla sua vita normale. Deve diventare il "Sovrano di Nabari" per sopravvivere. Da Baka-Updates: Rokujou Miharu era uno studente delle medie superiori apparentemente riluttante che viveva nel suo mondo. Tuttavia, dentro di lui, si annidava il potere finale di Nabari, "Onnipotente". Per possedere un'arma così suprema, il branco di lupi di Iga giurò di riportare Miharu al villaggio di Iga. D'altra parte, l'insegnante di inglese di Miharu, Kumohira sensei, e il compagno di classe, Kouichi, erano i ninja Banten la cui missione era proteggere Miharu. Iniziò così una guerra intrapresa per la proprietà dell '“Onnipotente”. Per sopravvivere, Miharu deve entrare nel mondo nascosto di Nabari, per diventare il re.
